Современная биоинформатика связана с такими дисциплинами как системная биология, информатика, базы данных, системный анализ и компьютерное моделирование. В основе биоинформатики лежат новейшие достижения производства биочипов ДНК и геномных секвенаторов, компьютерных технологий и информатики, способных генерировать и обрабатывать терабайты экспериментальных данных.
Узнать больше
В Белорусском государственном университете на кафедре системного анализа и компьютерного моделирования факультета РфиКТ в 2016 году открыта специализация 1-31 03 07-02 «Биоинформатика». Специализация обучения выбирается студентами факультета радиофизики и компьютерных технологий в конце второго курса при выборе кафедры обучения.
Смотреть видеорепортаж об открытии специализации
Биоинформатика — междисциплинарная область, которая разрабатывает методы и программные средства для понимания биологических данных.
На кафедре системного анализа и компьютерного моделирования разрабатываются методы анализа генных последовательностей, обеспечивающие получение новой информации о живых организмах, выполняется обработка разнообразных биомедицинских изображений живых клеток, тканей и органов.
Узнать больше
Задачами биоинформатики являются сборка геномов новых организмов de novo и против референсной последовательности, аннотация и филогенетический анализ неизвестных геномов, автоматизированный анализ и 3D моделирование биомедицинских изображений высокого разрешения раковых опухолей, анализ и компьютерное моделирование полимеризации белка актина в живых клетках, разработка программного обеспечения для автоматизации анализа и моделирования результатов экспериментальных исследований
- Кафедры генетики, биохимии, зоологии биологического факультета БГУ
- РНПЦ онкологии и медицинской радиологии им Александрова Н.Н.
- ГНУ «Институт физиологии НАН Беларуси»
- ГНУ «Институт генетики и цитологии АН РБ»
- РНПЦ детской онкологии, гематологии и иммунологии
- РНПЦ эпидемиологии и микробиологии
- Институт здоровья Люксембурга (Luxembourg Institute of Health)
- Европейская лаборатория молекулярной биологии (EMBL – European Molecular Biology Laboratory), Германия
- Норвежский университетом наук о жизни (Norwegian University of Life Sciences)
Студенты, магистранты, аспиранты и сотрудники кафедры проходят научные стажировки в вышеуказанных учреждениях.
На кафедре системного анализа и компьютерного моделирования действует Кружок по биоинформатике, постоянно проводятся семинары, открытые лекции с приглашенными гостями. Подробнее тут [http://spma.bsu.by/ru/seminars].
Студенты имеют доступ к серверу: 14 ядерный Intel(R) Core(TM) i9-7940X CPU 3.1/4.3 GHz, Intel X299 чипсет, 64 Gb DDR4 2666 MHz RAM, 8 Tb HDD, GeForce GTX1070 8 Gb RAM GPU
«Излучение информативности признаков в клинической транскриптомике: экспрессия генов, экзонов и межсезонных сшивок», Мария Демидик, обладатель стипендии Wargaming
«Разработка программного обеспечения для таргетированной сборки целевых генов из данных полногеномного секвенирования насекомых», Владислав Вертелко, cовместно со Студенческой научно-исследовательской лабораторией биоинформатики и молекулярной эволюции животных, Кафедра зоологии Биологического факультета БГУ.
«Автоматизация сортировки нуклеотидных последовательностей согласно таксономическому положению», Максим Сиколенко, cовместно с Лабораторией «Центр аналитических и генно-инженерных исследований», Институт микробиологии НАН Беларуси. Репозиторий [https://github.com/masikol/barapost]
«Разработка метода и программных средств для диагностики онкологических заболеваний», Марина Чепелева, Совместно с Luxembourg Institute of Health, Грант БГУ 2019, 3-е место на конкурсе инновационных идей и проектов INNSTART BSU 2018
Исследование алгоритмов анализа данных для определения чувствительности раковых клеток к химиопрепаратам
Многофакторный анализ вариабельности генов Buchnera aphidicola относящихся к различным функциональным группам
Разработка автоматизированной системы хранения и анализа данных полноэкзомного секвенирования ДНК человека
Исследование разделения транскрипционных сигналов клеточных популяций с использованием методов скрытых переменных
Разработка клиент-серверного программного комплекса анализа данных флуоресцентной спектроскопии
|
Курс |
Семестр |
Перечень дисциплин специализации |
Часы |
Часы |
Зачёт ед. |
Форма отчетности |
|
3 |
6 |
Интеллектуальный анализ данных |
136 |
62 (34/28) |
3,5 |
зачёт |
|
4 |
7 |
Введение в биоинформатику |
144 |
66 (34/32) |
4,0 |
зачёт |
|
4 |
7 |
Анализ биомедицинских изображений |
124 |
66 (34/32) |
3,5 |
зачёт |
|
4 |
8 |
Программирование встроенных систем обработки информации |
120 |
62 (34/28) |
3,5 |
экзамен |
|
4 |
8 |
Моделирование биофизических систем |
116 |
62 (34/28) |
3,5 |
зачёт |
International course «Computational Systems Biology of Cancer: Single Cell Analysis», September 23-28 2019, Institut Curie, Paris, France
«German Conference on Bioinformatics 2019», September 16-19 2019, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany
Multidisciplinary graduate and post-graduate education in big data analysis for life sciences August 2019, Minsk, Belarus
Летняя школа «Биоинформатика в исследованиях развития и старения», август 2019, Институт Биоинформатики, Долгопрудный, Россия
Interdisciplinary summer school on mining of biological data, August 11th – 19th 2018, Ås, Norway
Летняя школа Биоинформатики «Интеллектуальный анализ данных», август 2017, Институт Биоинформатики, Долгопрудный, Россия
EMBL, Heidelberg, Germany https://www.embl.de/training/events/
Summer internship in Centre for Genomic Regulation, Barcelona, Spain. Waiting for 2020 registration. https://www.crg.eu/en/content/training-undergraduates/crg-summer-internship-programme
DKFZ Summer Internship, Heidelberg, Germany https://www.dkfz.de/en/phd-program/Internship_2019.html?m=1542976739
Летняя школа Биоинформатики https://bioinf.me/education/summer
Диплом за стендовый доклад «Исследование алгоритмов поиска статистических закономерностей в кодирующих и некодирующих нуклеотидных последовательностях», авторы Д.А. Сырокваш, Е.П. Гунько, Н.Н. Яцков, представленный на конкурс молодых ученных в рамках II Международной научной конференции «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» (к 50-летию ГНУ «Институт генетики и цитологии НАН Беларуси») / г. Минск, 13–16 октября 2015 г.
Инновационный проект «Программное обеспечение CellDataMiner» получил грант ГНТП на коммерциализацию проекта, 2015 г.
Диплом за 3 место на республиканском конкурсе молодежных проектов Russian StartUp Village (Москва, Сколково) за разработку программного обеспечения CellDataMiner для сегментации ядер на люминесцентных изображениях раковых клеток с использованием метода главных компонент в 2015 г.
Проект «Программный пакет CellDataMiner для анализа изображений раковых клеток» призер молодежного инновационного форума «Наука и бизнес», Минск, Беларусь, 2015 г.
Разработанный программный пакет GENEEXPRESSIONANALYSER участвовал в конкурсе инновационных проектов Фонда Сколково «Всероссийский Стартап Тур – 2015» в Минске, 14-15 апреля 2015 года, где вышел в финальную часть конкурса и вошел в 50 лучших проектов (из более чем 900 заявленных проектов)
Серебряная медаль конкурса «Лучший молодежный инновационный проект» в рамках Петербургской технической ярмарки за научную разработку проекта «Программное обеспечение GENEEXPRESSIONANALYSER для моделирования и анализа данных микрочипов ДНК» А.В. Саечников / IV Петербургская техническая ярмарка, Санкт-Петербург, Россия, 27 марта 2015 г.
Диплом и кубок лауреата V Республиканского конкурс инновационных проектов 2014 года в номинации «Лучший инновационный проект» за научную разработку проекта «Программный пакет CellDataMiner для анализа изображений раковых клеток» Е.В. Лисица, В.В. Апанасович, Н.Н. Яцков, В.В. Скакун / Государственный комитет по науке и технологиям Республики Беларусь, Минск, 19 декабря 2014 г.
Диплом конкурса «Лучший инновационный проект и лучшая научно-техническая разработка года» в рамках Петербургской технической ярмарки за научную разработку проекта «Программный пакет CellDataMiner для интеллектуального анализа люминесцентных изображений раковых клеток» Е.В. Лисица, Н.Н. Яцков, Т.В. Апанасович, В.В. Апанасович / IV Петербургская техническая ярмарка, Санкт-Петербург, Россия, 12 – 14 марта 2014 г.
Диплом от председателя Государственного комитета по науке и технологиям Республики Беларусь за научную разработку проекта «Программный пакет CellDataMiner для интеллектуального анализа люминесцентных изображений раковых клеток» Е.В. Лисица, Н.Н. Яцков, Т.В. Апанасович, В.В. Апанасович / IV Ярмарка инновационных идей, Минск 20 ноября 2013 г.
Скакун Виктор Васильевич
Зав. кафедрой системного анализа
и компьютерного моделирования
тел. раб: +375 17 398 7042
skakun@bsu.by
Яцков Николай Николаевич
Председатель постоянно действующего
семинара “Биоинформатика”
Доцент кафедры системного анализа
и компьютерного моделирования
тел. раб: +375 17 398 0222
yatskou@bsu.by
